IOTA：
1. MIT报告指出，IOTA使用了自己开发的哈希算法curl，但是curl算法的哈希值极易发生碰撞，于是就能伪造数字签名。
2. 因为共识是由全网交易确定的，那么理论上来说，如果有人能够产生1/3的交易量，他就可以将无效交易变成有效交易。另一方面，由于IOTA无手续费，所以没有矿工激励，IOTA面临着拒绝服务攻击和垃圾信息攻击可能，就像不收物业费的小区，靠业主自治很难扫清不法份子。
3. IOTA引入闭源的中心化组件Coordinator来对全网交易进行检查（例如双花），如何有效移除Coordinator并建立一个具有良性激励机制的去中心化「Coordinator群体」，IOTA还没有给出解决方案。
Byteball：
由于主链算法和见证人发布频率有关系，交易确认的时间是不确定的；由于Byteball基于关系数据库来存储数据，SQL语言过于紧耦合算法逻辑，在一定程度上限制了Byteball目前的扩展能力和速度。
NANO：
没有被充分测试、缺乏同行评议，共识算法可能有严重缺陷的风险。例如，如果没有足够的法定人数投票来解决网络冲突会发生什么？如果NANO网络的某些部分长时间分离，当分离的网络重新加入时会发生什么？重新加入的网络是否会在不可避免发生的投票过程中瘫痪？这些问题都有待测试验证。
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