除了
碳交易外，政府还可以对
碳排放直接收税，以碳税的方式来增加碳排放的成本。
和碳交易相比较，我们不难发现碳税机制有明显的缺点：碳排放的价格是政府规定的，可能过高（造成过高的经济成本），也可能过低（造成控碳不力）；更重要的是因为没有交易机制，无法让最有能力控碳、减排的企业来承担主要责任，达不到效率的最大化。
和“一刀切”的行政化征收碳税相比，市场化的碳交易好处在于引导企业以最低成本减排，减少社会总成本。
企业可以选择通过技术改进等手段减少排放，也可以在市场上购买碳配额来履行减排义务。这两种方式对不同企业来说，成本必然不同。
比如碳配额的拍卖，排放成本越高的企业越愿意用更高的价格去竞拍。
政府通过竞拍可以获取更大额的资源，反过来又能用这些资金对进行补贴，快速提升减排技术。推动减排成本低的企业率先减排，实现最低的减排成本。
当政府收紧配额，碳价格处于高位，会倒逼更多减排成本较高的高污染企业进行主动减排。这是双赢的作为。
此外，碳交易市场能够吸引多类市场参与者，包括企业、银行、基金，这些机构的参与会进一步提升资源配置效率。
除常规配额交易外，还可开展配额期货、期权等衍生品交易，进一步提高市场效率。
尽管碳交易市场具有高效又灵活的优势，但资源配置机制的运行是有成本的，需要一套复杂的制度设计支撑。
在碳交易体系下，控制排放量并合理给碳定价的先决条件是，需要对碳排放清晰准确地度量，没有度量就没有精准的控排和定价。
要想保证
碳市场的高效可持续运行，就需要建立一个稳健的监测、报告、核查(MRV)体系，对碳排放的数据进行监控。
整个体系需要监测技术支撑、完善的法律法规支持，涉及政府、控排企业和第三方核查机构等通力合作，这必然会产生更多的协调和监督成本。
而开征碳税往往只需借助现有的征税体系，相对简单易行，不需要构建起一套全新的专用MRV体系。因此，碳市场的实施成本通常高于碳税。
和碳交易不同，由于碳税属于税法框架下的内容，相对稳定，短期不会改弦更张，往往有更高的制度稳定性。
碳税是一个事先确定的固定碳价，好处是市场主体因此可以对减排技术研发、投资形成一个比较稳定的收益预期，这有利于企业促进创新、据此调整生产进行长期计划。
正是由于碳税制度和碳交易体系各有优劣，许多国家会同时使用这两种碳定价工具，相互补充，扩大碳定价覆盖范围，以此对碳排放形成较大约束力度。
碳税的征税范围广，适用于小型、分散和移动的排放源（比如汽车燃料、居民部门和小工业部门）。碳交易的MRV要求高，又需要市场主体合作，主要针对固定大型排放措施（比如电力和大工业部门）。
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