文件明确指出“对纳入机制的电量，市场交易均价低于或高于机制电价的部分，由电网企业按规定开展差价结算，结算费用纳入当地系统运行费用”。根据国家发展改革委《关于第三监管周期省级电网输配电价及有关事项的通知》，系统运行费用是工商业用户用电价格的其中一部分，并不会出现在其他经营主体的结算科目中。可以看出，机制电价差价结算的费用就是由全体工商业用户来分摊和分享的。也有人担心增加的系统运行费用会导致电价上涨，其实不然。从差价结算的本质看，机制电价差价结算是对市场均价与机制电价进行“多退少补”。以存量项目为例，假设机制电价为燃煤基准价，当市场均价低于燃煤基准价时，在系统运行费用中增加“少补”部分，用户的系统运行费用抬高，但上网电价下降；当市场均价高于燃煤基准价时，在系统运行费用中扣除“多退”部分，用户的上网电价上升但系统运行费用下降。最终，由上网电价、系统运行费用等共同构成的用户用电价格，并不会产生明显波动。
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